Rico, Ciro ; Drake, Pilar ; Macpherson, Enrique; Cuesta, José A. Estimación de la diversidad genética y del tamaño efectivo de la población de coquina Donax trunculus del Parque Nacional de Doñana y su contribución a áreas no protegidas, in Proyectos de investigación en parques nacionales: convocatoria 2011-2014. Ministerio de Agricultura y Pesca, Alimentación y Medio Ambiente : 177-192 (2017) DIGITAL CSIC
[EN]We have studied seven populations of the wedge clam Donax trunculus, distributed throught the Spanish Atlantic and Mediterranean coasts. A comparative analysis of size and density was performed from a sample obtained from a commercially exploited population from Isla Canela, and from another population which is managed under a strict plan using only artisanal hand dredging from the beach of the Doñana National Park showing that the management carried out in the Doñana National Park is correct and allows sustainable fisheries. Twenty one microsatellite loci were isolated and characterized in D. trunculus of which 16 were polymorphic and codominant. At least 12 of them have high frequencies of null alleles in all populations, and the rest in most populations. All collected samples were genotyped with these 16 loci and genetic diversity indices, tests of disequiibrium, fixation indices and probabilities of genetic differentiation among localities were determined. The odds of assignment to the sampling location were also determined. Several analyses were conducted to determine the potential causes for the deviations from Hardy-Weinberg equilibrium which shown that they were mainly due to the presence of null alleles. Furthermore, using the ribosomal internal transcribed spacer it was determined that the commercially exploited populations of the wedge clam under the specific name Donax trunculus are actually a mixture of a hybrid and non-hybrid species. The analysis of the genetic structure made both to all individuals and separately for hybrid and non-hybrid individuals showed four genetically distinct populations in the Spanish coast. The first in the Cantabric Sea, the second in the Gulf of Cadiz, the third from the Strait of Gibraltar to Cabo de Gata and the last one from the Cabo de Gata to the Gulf of Rosas.
[ES]Se han estudiado ejemplares de coquina, Donax trunculus en 7 localidades distribuidas por las costas peninsulares atlánticas y mediterráneas españolas. Se ha hecho un análisis comparado de datos de tallas y densidad obtenidos en una localidad explotada (Isla Canela) y otra protegida (playa del Parque Nacional de Doñana), que muestran que la gestión llevada a cabo en el Parque Nacional Doñana es la correcta y permite una pesca sostenible. Se aislaron y caracterizaron 21 loci de microsatélites de los cuales 16 resultaron polimórficos y codominantes. De ellos al menos 12 presentan elevadas frecuencias de alelos nulos en todas las poblaciones, y el resto en la mayoría de poblaciones. Todas las muestras fueron genotipadas con estos 16 loci y se determinaron los índices de diversidad genética, pruebas de equilibrio, índices de fijación y las probabilidades de diferenciación entre localidades. También se determinaron las probabilidades de asignación a la localidad de muestreo. Se realizaron diversos análisis para determinar las causas potenciales de las desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg y se demostró que se deben principalmente a alelos nulos. Se descubrió mediante el análisis del marcador ribosomal ITS que las poblaciones de coquina explotadas comercialmente en España bajo la denominación específica Donax trunculus son en realidad una mezcla de una especie híbrida y una no híbrida. El análisis de la estructura genética, tanto el realizado a todos los individuos como de forma separada para individuos híbridos y no-híbridos, demostró que existen cuatro poblaciones genéticamente distintas en el litoral español. La primera en el Mar Cantábrico, la segunda en el Golfo de Cádiz, la tercera entre el Estrecho de Gibraltar y el Cabo de Gata y la última entre el Cabo de Gata y el Golfo de Rosas.