La investigación que se lleva a cabo en el CEAB tiene como objetivos generales el identificar la diversidad de organismos y entender sus funciones e interacciones en la naturaleza, así como la aplicación de este conocimiento en el uso y gestión racional de los recursos de nuestro planeta y la predicción de respuestas a modificaciones ambientales. Para ello se emplea una amplia gama de estudios y aproximaciones que abarcan desde la composición bioquímica y genética de los organismos hasta la estructura y dinámica de poblaciones y ecosistemas.
El CEAB aspira a ser un centro con reputación internacional que sea referente nacional en Biología Marina, Limnología y Ecología. Su propósito es desarrollar una investigación técnicamente actualizada y conceptualmente sólida y creativa, que permita contribuir al avance del conocimiento y a su aplicación para afrontar los retos que se plantean en el desarrollo de una sociedad sostenible.
El personal científico del CEAB se agrupa en dos Departamentos: el Dept. de Ecología Continental y el Dept. de Ecología Marina, cuya labor científica se desarrolla, respectivamente, en dos líneas de investigación: Dinámica Limnológica y Diversidad y Ecologia del Bentos Marino.
