{"id":11600,"date":"2024-03-22T11:52:34","date_gmt":"2024-03-22T10:52:34","guid":{"rendered":"https:\/\/www.ceab.csic.es\/infraestructuras-singulares\/laboratori-de-biologia-computacional\/"},"modified":"2024-06-05T12:41:09","modified_gmt":"2024-06-05T10:41:09","slug":"laboratorio-de-biologia-computacional","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.ceab.csic.es\/es\/infraestructuras-singulares\/laboratorio-de-biologia-computacional\/","title":{"rendered":"Laboratorio de Biolog\u00eda Computacional (CBLab)"},"content":{"rendered":"\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t\t\t\n\t\t\t\t<\/i>\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t\t\t\t\tInfraestructuras singulares<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/span>\n\t\t\t\t\t<\/a>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t
\n\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t
\n\t\t

\n\t\tInfraestructuras<\/span> singulares<\/span>\t<\/p>\n<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t

\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t
\n\t\t

\n\t\tLaboratorio<\/span> de<\/span> Biolog\u00eda<\/span> Computacional<\/span> (CBLab)<\/span>\t<\/h1>\n<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t
\n\t\t\t\t\t
\n\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t

El Laboratorio se crea como respuesta a la creciente demanda de capacidad de computaci\u00f3n ligada a la I+D de frontera que se desarrolla en el CEAB y vinculada a distintos aspectos de la ecolog\u00eda.<\/h2>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t

Se dispone de un Cl\u00faster de computaci\u00f3n de Alto Rendimiento<\/strong> (Cl\u00faster CAR) de uso com\u00fan y compartido y que ha sido financiado por los recursos de infraestructura del propio centro y por el Ministerio de Econom\u00eda y Competitividad.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t

\n\t\t\t\t\t
\n\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t

Equipos y caracter\u00edsticas:
<\/strong>La capacidad total del Cl\u00faster CAR es de 13 nodos de computaci\u00f3n, que suman un total de 284 procesadores, 2671 GB de RAM y 65 TB de espacio de disco de alto rendimiento, aparte de 4 NAS de almacenamiento de varios proyectos de investigaci\u00f3n vinculados al cluster de unos 43 TB de capacidad cada uno. Adem\u00e1s, cuenta con cuatro servidores que suman un total de 72 \u00abcores\u00bb y 312G de RAM por usos m\u00e1s all\u00e1 de la computaci\u00f3n (como m\u00e1quinas virtuales y servidores relacionados con la formaci\u00f3n y la transmisi\u00f3n de ciencia ciudadana)<\/p>


Objetivos cient\u00edficos:<\/strong><\/p>

1. Bioinform\u00e1tica y ecolog\u00eda molecular: <\/strong>potenciar estos campos en el CEAB, organizando, centralizando y actualizando peri\u00f3dicamente todo el software bioinform\u00e1tico que utiliza el centro, y aumentando las capacidades de c\u00e1lculo.<\/p>

2. Ecolog\u00eda te\u00f3rica y computacional:<\/strong> potenciarla mediante el desarrollo e implementaci\u00f3n de t\u00e9cnicas estad\u00edsticas, matem\u00e1ticas y de simulaci\u00f3n aplicadas a sistemas ecol\u00f3gicos. Aumentar la capacidad de c\u00e1lculo, centralizar y actualizar software en R, Matlab o Python para realizar estudios te\u00f3ricos y an\u00e1lisis estad\u00edsticos con alta demanda de recursos computacionales (ej. Bootstrapping).<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t

\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t\t\t\t\t

3. Miner\u00eda de datos y Knowledge Discovery in Databases (KDD): <\/strong>Facilitar y promover la utilizaci\u00f3n de todo tipo de t\u00e9cnicas propias del aprendizaje autom\u00e1tico y la inteligencia artificial, como el descubrimiento de conocimiento en bases de datos (KDD), la miner\u00eda de datos (Data Mining<\/em>), y los sistemas expertos, organizando y centralizando software para ello y formando a los investigadores en estas disciplinas, que ya son imprescindibles en estudios de ecolog\u00eda avanzada.<\/p>

4. Formaci\u00f3n: <\/strong>Para sentar las bases de una ecolog\u00eda m\u00e1s cuantitativa y conceptualmente m\u00e1s s\u00f3lida es necesario que las nuevas generaciones de ec\u00f3logos aprendan lenguajes de programaci\u00f3n y entiendan el funcionamiento y la utilidad de un cl\u00faster CAR. Sin embargo, es necesaria la formaci\u00f3n en disciplinas como la algor\u00edtmica y la miner\u00eda de datos, la gesti\u00f3n de bases de datos, aplicaciones, SIG, etc. Este aprendizaje permite tener herramientas cient\u00edficas m\u00e1s poderosas para resolver problemas complejos. En este sentido, el CBLab no s\u00f3lo se limita al cl\u00faster CAR sino que pretende ser un laboratorio \u201cvivo\u201d con la implicaci\u00f3n de t\u00e9cnicos de apoyo y de investigadores del centro, asesor\u00eda individual o en grupos, workshops interdisciplinares y otros. Todo ello con el objetivo de establecer puentes operativos entre teor\u00eda y empirismo y producir una ecolog\u00eda m\u00e1s cuantitativa e interdisciplinaria.<\/p>\t\t\t\t\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t

\n\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t

Informaci\u00f3n para los usuarios<\/h3>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t
El CBLab y en particular su infraestructura b\u00e1sica (cl\u00faster CAR) ofrece un servicio transversal a todos los grupos de investigaci\u00f3n del CEAB, a la vez presta servicios a usuarios externos.<\/div>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t
\n\t\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t

Contacto<\/h3>\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t<\/div>\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t
\n\t\t\t\t\t\t\t