{"id":11785,"date":"2024-05-02T08:37:52","date_gmt":"2024-05-02T06:37:52","guid":{"rendered":"https:\/\/www.ceab.csic.es\/projectes-recerca\/aproximacio-ecologica-i-metagenomica-a-les-interaccions-biologiques-del-microbioma-ambiental-interactoma\/"},"modified":"2026-04-27T12:37:19","modified_gmt":"2026-04-27T10:37:19","slug":"interactoma","status":"publish","type":"projectes-recerca","link":"https:\/\/www.ceab.csic.es\/es\/proyectos-investigacion\/interactoma\/","title":{"rendered":"Aproximaci\u00f3n ecol\u00f3gica y metagen\u00f3mica a las interacciones biol\u00f3gicas del microbioma ambiental (INTERACTOMA)"},"content":{"rendered":"<div class=\"project_excerpt\">\n<p>INTERACTOMA propone enfoques computacionales que exploten la co-ocurrencia de genes con funci\u00f3n conocida y desconocida y la co-ocurrencia ambiental de diferentes especies microbianas para generar hip\u00f3tesis y priorizar objetivos de investigaci\u00f3n futura con inter\u00e9s ecol\u00f3gico o biotecnol\u00f3gico, utilizando como sistemas modelo lagos salinos y lagos alpinos, as\u00ed como el microbioma de especies hospedadoras de animales y plantas a lo largo de gradientes clim\u00e1ticos y geogr\u00e1ficos.<\/p>\n<\/div>\n<p>Los microorganismos son extremadamente abundantes y cosmopolitas en la biosfera. Por sus altas tasas de crecimiento y alta relaci\u00f3n superficie \/ volumen, son la superficie biol\u00f3gica m\u00e1s grande y m\u00e1s reactiva de la Tierra. Por lo tanto, la mayor\u00eda de las funciones de los ecosistemas est\u00e1n condicionadas por la actividad y la abundancia del componente microbiano. A nivel global, los microbios dominan los procesos relevantes en los ecosistemas acu\u00e1ticos, como la producci\u00f3n primaria, la respiraci\u00f3n y la g\u00e9nesis y degradaci\u00f3n de las part\u00edculas. Asimismo, participan en la producci\u00f3n y degradaci\u00f3n (mineralizaci\u00f3n) de la materia org\u00e1nica y son una parte esencial de los ciclos de nutrientes, constituyendo la base de la mayor\u00eda de las cadenas tr\u00f3ficas con inter\u00e9s comercial. Aunque pasan desapercibidos, su actividad contribuye de manera muy significativa a los fen\u00f3menos atmosf\u00e9ricos globales, con respuestas al cambio clim\u00e1tico y al uso sostenible de los recursos naturales impredecibles y poco estudiadas. Dos de las tareas m\u00e1s desafiantes en la actualidad en ecolog\u00eda microbiana son (i) la caracterizaci\u00f3n de los genes con funciones desconocidas ampliamente presentes en las prospecciones metagen\u00f3micas y (ii) obtener informaci\u00f3n sobre las interacciones del microbioma in situ. En el presente proyecto se proponen enfoques computacionales que explotan la co-ocurrencia de genes con funci\u00f3n conocida y desconocida y la co-ocurrencia ambiental de diferentes especies microbianas para generar hip\u00f3tesis y priorizar objetivos de investigaci\u00f3n futura con inter\u00e9s ecol\u00f3gico o biotecnol\u00f3gico. Inicialmente utilizaremos sistemas microbianos simplificados bien conocidos para probar el enfoque (lagos salinos con fuertes gradiente de salinidad) y, a continuaci\u00f3n, nos centraremos en los lagos alpinos y las co-ocurrencias de los posibles grupos de par\u00e1sitos archaea DPANN y par\u00e1sitos microeucariotas recientemente descritos. Tambi\u00e9n exploraremos el filtrado bi\u00f3tico de microbiomas a lo largo de especies hospedadoras de animales y plantas en gradientes clim\u00e1ticos y geogr\u00e1ficos. El enfoque tambi\u00e9n se aplicar\u00e1 a las interacciones gen-gen en datasets metagen\u00f3micos para abordar la llamada \u00abmateria oscura biol\u00f3gica\u00bb utilizando co-ocurrencias no aleatorias con genes de funci\u00f3n conocida.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>INTERACTOMA propone enfoques computacionales que exploten la co-ocurrencia de genes con funci\u00f3n conocida y desconocida y la co-ocurrencia ambiental de diferentes especies microbianas para generar hip\u00f3tesis y priorizar objetivos de investigaci\u00f3n futura con inter\u00e9s ecol\u00f3gico o biotecnol\u00f3gico, utilizando como sistemas modelo lagos salinos y lagos alpinos, as\u00ed como el microbioma de especies hospedadoras de animales y 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