Mi campo de investigación es la Ecología Microbiana acuática y aérea. Mis actividades de investigación actuales están orientadas a explorar la dinámica temporal y la diversidad de microorganismos en el aire, así como el estudio de la ecología y la diversidad de los microorganismos eucariotas (protists) de diferentes sistemas acuáticos del interior (los lagos de alta montaña, lagunas de agua salada y estanques euxínicos). Recientemente he llevado a cabo diferentes colaboraciones sobre otros aspectos de la ecología microbiana.