El rápido desarrollo de las técnicas de secuenciación de alto rendimiento está generando oportunidades revolucionarias para la investigación de la biodiversidad, siendo ejemplos destacados el estudio del ADN ambiental (eDNA) y de los patógenos microscópicos. El estudio del eDNA proporciona un grado sin precedentes de automatización y estandarización metodológica para la detección de la biodiversidad, reduciendo significativamente los esfuerzos de muestreo tradicionales y los sesgos taxonómicos. Esto facilita una detección integral de la biodiversidad nativa presente en las comunidades marinas, que a menudo interactúan con especies no indígenas (NIS, por sus siglas en inglés). Las aplicaciones del metabarcoding basado en eDNA tienen un amplio alcance en la gestión y conservación de los hábitats marinos, y actualmente el metabarcoding es ya una metodología plenamente consolidada para el seguimiento de la biodiversidad marina.
En este proyecto consideraremos tanto el ADN organísmico como el ADN extraorganísmico. Nuestras investigaciones recientes han demostrado la versatilidad de los estudios basados en eDNA para analizar distintos aspectos de la biodiversidad marina, desde patrones biogeográficos a gran escala hasta la detección de patógenos en actividades acuícolas. BlueDNA se centrará en comprender la dinámica poblacional del zooplancton y del meroplancton mediante metabarcoding y metafilogeografía basados en eDNA, proporcionando datos precisos y herramientas fiables para evaluar los cambios en la biodiversidad y la resiliencia de estas comunidades marinas clave, sometidas a rápidos cambios y todavía insuficientemente estudiadas.
Otra de las tareas de BlueDNA consistirá en reconstruir las historias de colonización de especies no indígenas, un objetivo tradicionalmente limitado por la disponibilidad de datos históricos. Como parte de un proyecto actualmente en curso, nuestro equipo de investigación ha logrado reconstruir varias historias de invasión de especies no indígenas a lo largo de siglos mediante el análisis de núcleos sedimentarios. BlueDNA irá un paso más allá y obtendrá conjuntos de datos de metabarcoding de ADN ambiental antiguo preservado en sedimentos para detectar patrones históricos de introducción de especies no indígenas en diversos estuarios que cuentan con registros históricos detallados.
Finalmente, BlueDNA estudiará la dinámica de enfermedades emergentes asociadas a protistas en la acuicultura marina de moluscos, las cuales representan importantes desafíos para este sector productivo. En conjunto, BlueDNA aprovechará nuevos enfoques basados en datos masivos de comunidades biológicas para comprender en profundidad cómo la biodiversidad nativa, los patógenos y las especies no indígenas influyen en las comunidades marinas, y proporcionará directrices para mejorar la conservación y la gestión sostenible de los recursos marinos.